EDEN by Basecamp Research
Concevez des antibiotiques et priorisez des cibles vaccinales contre les agents pathogènes résistants aux médicaments avec EDEN, le modèle de fondation biologique de Basecamp Research
Ajouter à Claude (opens in new tab)EDEN est le modèle de fondation biologique de pointe de Basecamp Research, entraîné sur BaseData — le plus grand jeu de données biologiques au monde, comprenant plus de 10 milliards de gènes inédits provenant de plus d'un million d'espèces, collectées lors de plus de 200 expéditions dans plus de 30 pays.
Ce connecteur donne à Claude accès à deux capacités d'EDEN :
Conception d'antibiotiques (EDEN-AMP) : Générez de nouveaux candidats peptides antimicrobiens avec une puissance prédite contre 11 souches bactériennes résistantes aux médicaments, dont le SARM, Acinetobacter baumannii et Pseudomonas aeruginosa. 97 % des AMPs conçus par EDEN sont actifs en laboratoire ; un candidat a démontré une efficacité chez la souris comparable aux antibiotiques de dernier recours.
Priorisation des cibles vaccinales (EDEN-Immunogenicity) : Prédisez la probabilité qu'un antigène codant une protéine déclenche une réponse immunitaire, en utilisant les embeddings EDEN avec un AUROC de 0,85 sur les données de validation externe. Réduit à un seul workflow ce qui prenait des semaines de sélection empirique de cibles. Chaque séquence BaseData est collectée dans le cadre d'accords de consentement éclairé et de partage des bénéfices, chaque séquence étant traçable jusqu'aux permis de collecte spécifiques à chaque pays. Réservé à un usage de recherche uniquement.
Outils
- create_dataset_upload
- delete_dataset
- generate_antimicrobial_peptides
- list_datasets
- predict_immunogenicity
- create_dataset_download
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