EDEN by Basecamp Research
Basecamp Research의 생물학 파운데이션 모델 EDEN으로 항생제를 설계하고 약물 내성 병원균에 대한 백신 타깃을 우선순위화하세요
Claude에 추가 (opens in new tab)EDEN은 Basecamp Research의 최첨단 생물학 파운데이션 모델로, 30개국 이상에서 진행된 200회 이상의 샘플링 원정을 통해 100만 종 이상에서 수집한 100억 개 이상의 신규 유전자를 포함한 세계 최대 생물학 데이터셋인 BaseData를 기반으로 훈련되었습니다.
이 커넥터는 Claude에 두 가지 EDEN 기능을 제공합니다:
항생제 설계 (EDEN-AMP): MRSA, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa를 포함한 11종의 약물 내성 세균 균주에 대해 예측 효능을 갖춘 새로운 항균 펩타이드 후보물질을 생성합니다. EDEN이 설계한 AMP의 97%는 실험실에서 활성을 보이며, 한 후보물질은 마우스 실험에서 최후 수단 항생제에 버금가는 효능을 나타냈습니다.
백신 타깃 우선순위화 (EDEN-Immunogenicity): EDEN 임베딩을 활용해 단백질 코딩 항원이 면역 반응을 유발할 확률을 예측하며, 외부 검증 데이터에서 AUROC 0.85를 달성했습니다. 수 주가 걸리던 경험적 타깃 선정 과정을 단일 워크플로우로 단축합니다. 모든 BaseData 시퀀스는 사전 동의 및 이익 공유 계약 하에 수집되며, 각 시퀀스는 국가별 채집 허가서까지 추적 가능합니다. 연구 목적으로만 사용 가능합니다.
도구
- create_dataset_upload
- delete_dataset
- generate_antimicrobial_peptides
- list_datasets
- predict_immunogenicity
- create_dataset_download
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