EDEN by Basecamp Research

Basecamp Research의 생물학 파운데이션 모델 EDEN으로 항생제를 설계하고 약물 내성 병원균에 대한 백신 타깃을 우선순위화하세요

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EDEN은 Basecamp Research의 최첨단 생물학 파운데이션 모델로, 30개국 이상에서 진행된 200회 이상의 샘플링 원정을 통해 100만 종 이상에서 수집한 100억 개 이상의 신규 유전자를 포함한 세계 최대 생물학 데이터셋인 BaseData를 기반으로 훈련되었습니다.

이 커넥터는 Claude에 두 가지 EDEN 기능을 제공합니다:

항생제 설계 (EDEN-AMP): MRSA, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa를 포함한 11종의 약물 내성 세균 균주에 대해 예측 효능을 갖춘 새로운 항균 펩타이드 후보물질을 생성합니다. EDEN이 설계한 AMP의 97%는 실험실에서 활성을 보이며, 한 후보물질은 마우스 실험에서 최후 수단 항생제에 버금가는 효능을 나타냈습니다.

백신 타깃 우선순위화 (EDEN-Immunogenicity): EDEN 임베딩을 활용해 단백질 코딩 항원이 면역 반응을 유발할 확률을 예측하며, 외부 검증 데이터에서 AUROC 0.85를 달성했습니다. 수 주가 걸리던 경험적 타깃 선정 과정을 단일 워크플로우로 단축합니다. 모든 BaseData 시퀀스는 사전 동의 및 이익 공유 계약 하에 수집되며, 각 시퀀스는 국가별 채집 허가서까지 추적 가능합니다. 연구 목적으로만 사용 가능합니다.

도구

  • create_dataset_upload
  • delete_dataset
  • generate_antimicrobial_peptides
  • list_datasets
  • predict_immunogenicity
  • create_dataset_download

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