EDEN by Basecamp Research
Basecamp Research の生物学的基盤モデル EDEN を活用して、抗生物質を設計し、薬剤耐性病原体に対するワクチンターゲットの優先順位付けを行います。
Claude に追加 (opens in new tab)EDEN は Basecamp Research のフロンティア生物学的基盤モデルです。30 カ国以上での 200 以上のサンプリング遠征で収集された 100 万種以上の生物から得た 100 億以上の新規遺伝子を含む、世界最大の生物学的データセット「BaseData」を基に学習されています。
このコネクターにより、Claude は 2 つの EDEN 機能を利用できます。
抗生物質設計（EDEN-AMP）：MRSA、Acinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosa を含む 11 種類の薬剤耐性菌株に対する効力予測付きで、新規の抗菌ペプチド候補を生成します。EDEN が設計した AMP の 97% がラボで活性を示し、ある候補は最後の手段となる抗生物質と同等の有効性をマウスで実証しました。
ワクチンターゲット優先順位付け（EDEN-Immunogenicity）：EDEN エンベディングを使用して、タンパク質コード抗原が免疫応答を引き起こす確率を予測します。外部検証データで AUROC 0.85 を達成し、数週間かかっていた実験的なターゲット選定を単一ワークフローに集約します。BaseData のすべての配列は、インフォームドコンセントと利益共有契約のもとで収集されており、各配列は国固有の採取許可証までトレーサブルです。研究目的専用です。
ツール
- create_dataset_upload
- delete_dataset
- generate_antimicrobial_peptides
- list_datasets
- predict_immunogenicity
- create_dataset_download
信頼できる開発者のコネクタのみご利用ください。Anthropicは開発者が提供するツールを管理しておらず、意図どおりに動作すること、または変更されないことを保証できません。
関連コネクタ
PubMed から生物医学文献を検索できます。
科学的な研究を探索できます。
ClinicalTrials.gov のデータにアクセスできます。
Garmin、WHOOP、Oura、Apple Health など 29 以上のアプリと連携し、Claude がトレーニング・睡眠・HRV を分析してワークアウトをウォッチに直接送信します。
bioRxiv および medRxiv のプレプリントデータにアクセスできます
ChEMBL データベースにアクセスできます