Comment utiliser le pack de compétences bioinformatiques scVI-Tools avec Claude

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    Sciences de la vie
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    https://claude.com/resources/tutorials/how-to-use-the-scvi-tools-bioinformatics-skill-bundle-with-claude

Qu'est-ce que le pack de compétences scVI-Tools ?

Une compétence unique qui fournit un accès complet à l'analyse monocellulaire basée sur l'apprentissage profond à l'aide de scvi-tools et de l'écosystème scVerse, couvrant l'intégration de lots (scVI, scArches), l'annotation de type de cellule (SCANVI, CellAssign), la déconvolution transcriptomique spatiale (DestVI, Tangram, cell2location, Stereoscope), l'analyse d'accessibilité à la chromatine (PeakVI, scBasset), l'intégration de données multimodales (TotalVI for CITE-seq, MultiVI for RNA+ATAC) et l'analyse des perturbations (contrastiveVI). Chaque compétence fournit des flux de travail étape par étape, des conseils de réglage des paramètres et du dépannage pour son modèle scvi-tools respectif.

Qui devrait utiliser le bundle de compétences scVI-Tools ?

Cette compétence est conçue pour les scientifiques qui analysent des données unicellulaires, notamment spatiales, épigénétiques et scRNA, et qui souhaitent tirer parti des méthodes d'apprentissage profond à partir d'outils scvi sans avoir à lire une documentation détaillée, ce qui est particulièrement utile pour les chercheurs travaillant avec des expériences multilots, des essais multimodaux (CITE-seq, multiome), de transcriptomique spatiale ou de scATAC-seq qui ont besoin de conseils sur la sélection de modèles, l'ajustement des paramètres et les bonnes pratiques.

Comment accéder aux compétences dans Claude Code

Commande 

/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

/plugin install scvi-tools@life-sciences

Comment accéder à la compétence dans Claude.ai

Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)

  1. Téléchargez le ZIP de la compétence scvi-tools ici
  2. Depuis Claude.ai, accédez à Paramètres d'administration > Capacités > Compétences
  3. Assurez-vous que Compétences est activé pour votre organisation
  4. Cliquez sur « Bibliothèque de compétences d'organisation »
  5. Cliquez sur « +Ajouter »
  6. Téléchargez le fichier zip de la compétence

En savoir plus sur le provisionnement et la gestion des compétences pour votre organisation

Pour les utilisateurs individuels de Claude

  1. Téléchargez le fichier ZIP de la compétence scvi-tools ici
  2. Depuis Claude.ai, accédez à Paramètres > Capacités > Compétences (si Compétences n'est pas disponible, contactez l'administrateur de votre équipe)
  3. Cliquez sur « Télécharger une compétence »
  4. Téléchargez le fichier zip de la compétence