Claude で scVI-Tools の生物情報学スキルバンドルを使用する方法

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    https://claude.com/resources/tutorials/how-to-use-the-scvi-tools-bioinformatics-skill-bundle-with-claude

scVI-Tools スキルバンドルとは?

scvi-tools および scVerse のエコシステムを活用した、深層学習ベースの単一細胞解析を包括的に提供する単一スキルです。バッチ統合(scVI、scArches)、細胞タイプアノテーション(SCANVI、CellAssign)、空間トランスクリプトミクス分解(DestVI、Tangram、cell2location、Stereoscope)、クロマチンのアクセシビリティ分析(PeakVI、scBasset)、マルチモーダルデータ統合(CITE-seq 用 TotalVI、RNA+ATAC 用 MultiVI)、摂動分析(contrastiveVI)を網羅しています。各スキルでは、対応する scvi-tools モデルごとに、ステップバイステップのワークフロー、パラメータ調整のガイダンス、およびトラブルシューティングを提供します。

scVI-Tools スキルバンドルを使用する対象ユーザーは?

このスキルは、単一細胞解析(空間解析、エピジェネティクス解析、単一細胞RNAシーケンスなど)を行う科学者向けに設計されており、scvi-toolsの深層学習手法を活用するために、膨大なドキュメントを読み込む必要はありません。特に、複数バッチ実験、マルチモーダルアッセイ(CITE-seq、マルチオーム)、空間トランスクリプトミクス、または scATAC-seq を扱う研究者にとって有用であり、モデル選択、パラメータ調整、ベストプラクティスに関するガイダンスが必要な場合に最適です。

Claude Code のスキルにアクセスする方法

コマンド 

/plugin marketplace add anthropics/life-sciences

/plugin install scvi-tools@life-sciences

Claude.ai のスキルにアクセスする方法

組織オーナー(Team および Enterprise ユーザー)向け

  1. scvi-tools スキル用の ZIP をここからダウンロードする
  2. Claude.ai から、管理者設定>機能>スキルに移動する
  3. 組織内でスキルが有効になっていることを確認する
  4. 「組織スキルライブラリ」をクリックする
  5. 「+追加」をクリックする
  6. スキル zip ファイルをアップロードする

組織向けのスキルプロビジョニングと管理についてご覧ください

Claude 個人ユーザー向け

  1. scvi-tools スキル用の ZIP ファイルをここからダウンロードする
  2. Claude.ai から、設定>機能>スキルに移動する(スキルが利用できない場合、チーム管理者に連絡してください)
  3. 「スキルをアップロード」をクリックする
  4. スキル zip ファイルをアップロードする