EDEN by Basecamp Research
Entwirf Antibiotika und priorisiere Impfstoffziele gegen arzneimittelresistente Krankheitserreger mit EDEN, dem biologischen Foundation Model von Basecamp Research
Zu Claude hinzufügen (opens in new tab)EDEN ist das biologische Frontier-Foundation-Model von Basecamp Research, trainiert auf BaseData – dem weltweit größten biologischen Datensatz mit über 10 Milliarden neuartigen Genen aus mehr als einer Million Arten, gesammelt auf über 200 Expeditionen in 30+ Ländern.
Dieser Connector gibt Claude Zugang zu zwei EDEN-Funktionen:
Antibiotikadesign (EDEN-AMP): Generiere neuartige antimikrobielle Peptidkandidaten mit vorhergesagter Wirksamkeit gegen 11 arzneimittelresistente Bakterienstämme, darunter MRSA, Acinetobacter baumannii und Pseudomonas aeruginosa. 97 % der von EDEN entworfenen AMPs sind im Labor aktiv; ein Kandidat zeigte bei Mäusen eine mit Reserveantibiotika vergleichbare Wirksamkeit.
Priorisierung von Impfstoffzielen (EDEN-Immunogenicity): Sage die Wahrscheinlichkeit vorher, dass ein proteinkodierendes Antigen eine Immunantwort auslöst, mithilfe von EDEN-Embeddings mit AUROC 0,85 auf externen Validierungsdaten. Reduziert wochenlange empirische Zielauswahl auf einen einzigen Workflow. Jede BaseData-Sequenz wird unter informierten Einwilligungs- und Gewinnbeteiligungsvereinbarungen gesammelt, wobei jede Sequenz auf länderspezifische Sammelgenehmigungen zurückverfolgbar ist. Nur für Forschungszwecke.
Tools
- create_dataset_upload
- delete_dataset
- generate_antimicrobial_peptides
- list_datasets
- predict_immunogenicity
- create_dataset_download
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