EDEN by Basecamp Research

Progetta antibiotici e individua i target vaccinali contro i patogeni farmacoresistenti con EDEN, il modello fondativo biologico di Basecamp Research

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EDEN è il modello fondativo biologico di frontiera di Basecamp Research, addestrato su BaseData — il più grande dataset biologico al mondo, che comprende oltre 10 miliardi di geni inediti provenienti da più di un milione di specie, raccolti nel corso di 200+ spedizioni di campionamento in oltre 30 paesi.

Questo connector offre a Claude l'accesso a due funzionalità di EDEN:

Progettazione di antibiotici (EDEN-AMP): genera candidati peptidi antimicrobici inediti con potenza prevista contro 11 ceppi batterici farmacoresistenti, tra cui MRSA, Acinetobacter baumannii e Pseudomonas aeruginosa. Il 97% dei peptidi antimicrobici progettati da EDEN risulta attivo in laboratorio; un candidato ha mostrato un'efficacia nei topi paragonabile a quella degli antibiotici di ultima istanza.

Prioritizzazione dei target vaccinali (EDEN-Immunogenicity): prevede la probabilità che un antigene codificante una proteina scateni una risposta immunitaria, utilizzando gli embedding di EDEN con AUROC 0,85 su dati di validazione esterni. Riduce settimane di selezione empirica dei target a un singolo flusso di lavoro. Ogni sequenza di BaseData è raccolta nel rispetto di accordi di consenso informato e condivisione dei benefici, con tracciabilità fino ai permessi di raccolta specifici per paese. Solo per uso nella ricerca.

Strumenti

  • create_dataset_upload
  • delete_dataset
  • generate_antimicrobial_peptides
  • list_datasets
  • predict_immunogenicity
  • create_dataset_download

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