Claude에서 ToolUniverse 확장 프로그램 사용

ToolUniverse MCP는 Claude가 600개 이상의 검증된 과학 도구 라이브러리를 활용하여, 방대한 가설 공간을 탐색하고, 상충하는 가설을 비교하며, 빠른 분석에서 느린 분석으로 확장되는 분석 사이클을 반복적으로 수행할 수 있게 합니다. 이 문서에서는 Claude와 ToolUniverse 통합을 설정 및 사용하는 방법을 설명합니다.

ToolUniverse 통합 기능은 Claude Desktop App에서 데스크톱 확장 프로그램(여기에서 다운로드) 형태로 제공되며, 데스크톱 확장을 통해 로컬 커넥터를 사용할 수 있는 Claude의 기능을 기반으로 작동합니다.

ToolUniverse 통합 정보

ToolUniverse는 연구원과 협업하여 가설을 생성하고, 이를 실행 가능한 연구 계획으로 전환하며, 과학 도구를 실행하고, 결과에 따라 분석을 지속적으로 업데이트하도록 설계된 과학 연구용 생태계입니다. 이는 AI 과학자(AI scientist)와 과학용 AI 에이전트를 구축하는 데 초점을 둡니다. ToolUniverse의 목표는 대규모 연구를 통해 과학적 발견 방식을 새롭게 정의하는 것입니다. AI 과학자는 일회성 요약을 생성하는 대신, 방대한 가설 공간을 탐색하고, 상충하는 가설을 비교하며, 빠른 분석에서 느린 분석으로 확장되는 분석 사이클을 반복적으로 수행합니다.

TToolUniverse는 도구 사용 방식을 표준화합니다. AI 과학자는 도구를 로컬 Python 함수로 호출하거나, MCP를 통해 제공되는 원격 서비스로 호출해 탐색 및 실행할 수 있습니다. 이 설계는 각 단계를 검증 가능하게 만듭니다. AI 과학자는 데이터셋, 모델, 분석 파이프라인을 연결하는 엔드투엔드 워크플로우를 구성하고, 다음 행동을 선택하기 전에 입력과 출력을 기록합니다. ToolUniverse는 인간과 AI의 협업 과정에서 가설을 세우고, 정보 탐색용 도구를 호출하며, 연구 목표를 수행합니다. 그리고 새로운 실험 데이터가 유입되고 인사이트가 도출될 때마다 내부 모델을 정교화하는 지속적인 순환 구조를 지원합니다.

이 통합에서 사용 가능한 데이터셋 및 서비스

ToolUniverse의 면책 고지: ToolUniverse는 제3자 과학 데이터베이스 및 서비스에 대한 접근 권한을 제공합니다. 아래 나열된 데이터, 콘텐츠, 서비스에 대한 모든 저작권과 지적재산권은 각 해당 원 출처와 권리자에게 귀속됩니다. ToolUniverse는 통합 플랫폼 역할만 수행하며, 해당 외부 리소스의 정확성, 완전성, 지속적인 제공 가능성에 대해 어떠한 책임도 지지 않습니다.

ToolUniverse는 방대한 과학 리소스 생태계에 대한 접근 권한을 제공합니다.

생물학 데이터베이스 및 생물학 파운데이션 모델

• UniProt - 단백질 종합 지식 데이터베이스
• Ensembl - 유전체 데이터 및 주석
• RCSB PDB - 단백질 구조 데이터베이스
• ChEMBL - 생리활성 분자 및 신약 개발 데이터베이스
• NCBI 데이터베이스 - GenBank, RefSeq, SNP 데이터베이스
• Gene Ontology - 생물학적 과정, 기능 및 위치 주석
• ESM - 단백질 언어 모델
• TranscriptFormer - 단일 세포 파운데이션 모델

화학 및 의약품 데이터베이스

• PubChem - 화학 구조 및 생물학적 활성
• DrugBank - 의약품 및 약물 표적 데이터베이스
• ChEMBL - 생리활성 약물 유사 저분자
• FDA 데이터베이스 - 의약품 승인, 의약품 처방 정보, 이상반응, 적응증 및 금기 사항, 약물 상호작용
• ClinicalTrials.gov - 임상 시험 정보

문헌 및 지식 베이스

• PubMed - 생의학 문헌 데이터베이스
• Semantic Scholar - AI 기반 문헌 분석
• Europe PMC - 오픈 액세스 생의학 문헌
• OpenAlex - 학술 저작물 종합 데이터베이스
• Crossref - DOI 등록 및 메타데이터
• OpenTargets - 체계적인 약물 표적 선정을 위한 인사이트

유전체적 및 건강 데이터

• GTEx - 조직 특이 유전자 발현
• GWAS Catalog - 전장 유전체 연관 분석
• ClinVar - 유전적 변이 및 질병 간의 관계
• OMIM - 인간의 멘델 유전 방식 온라인 데이터베이스
• TCGA - 암 유전체 데이터

리서치 도구 및 API

• OpenTargets - 표적-질병 연관 정보
• STRING - 단백질-단백질 상호작용 네트워크
• KEGG - 경로 및 질병 정보
• Reactome - 생물학적 경로 데이터베이스
• InterPro - 단백질 패밀리 및 도메인

AI 모델, AI 에이전트, 파운데이션 및 생성형 모델, 시각화 및 과학적 워크플로우

• AlphaFold - 단백질 구조 예측
• BLAST - 서열 유사성 검색
• ADMET-AI - 약물 특성 예측 모델
• ChemTools - 화학정보학 유틸리티
• 시각화 도구 - 분자 및 데이터 시각화

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ToolUniverse 통합 기능은 어떤 사용자에게 적합한가요?

리서치 과학자 및 학계

가설 수립 속도를 높이고, 문헌 검토를 자동화하며, 다중 데이터베이스 기반의 복합 분석을 수행하며, 새롭게 등장하는 실험 및 AI-인간 협업 플랫폼에 맞춰 연구 역량을 확장합니다.

제약 및 바이오 기업

신약 개발 파이프라인을 간소화하고, 표적 발굴 역량을 강화하며, 화합물 설계 및 최적화를 개선합니다. 또한 가상 약물 스크리닝을 수행하고, 보고서 생성과 표적 평가 속도를 높여 리스크를 낮추고 검증을 지원합니다.

의료 조직

정밀 의학 이니셔티브를 강화하고, 환자 선정을 통한 임상 시험 설계 및 최적화를 지원하며, 약물유전체학 연구를 촉진합니다. 또한 환자군 분류 전략을 고도화하고, 다중모달 의료 데이터셋에서 예후 및 예측 바이오마커를 도출합니다.

데이터 과학자, ML 엔지니어, 플랫폼 및 인프라 엔지니어

맞춤형 개발 없이도 분야별 전문 도구에 접근하고, 과학 연구용 AI 에이전트를 신속하게 프로토타이핑하며, 과학적 데이터를 ML 워크플로우로 통합합니다.

정부 및 규제 기관

규제 의사 결정을 고도화하고, 이상반응 분석을 개선하며, 의약품 승인 절차 속도를 높이고, 종합적인 안전성 모니터링을 수행합니다.

누가 ToolUniverse 통합 기능에 접근할 수 있나요?

ToolUniverse는 Apache License 2.0 하의 오픈 소스로, ToolUniverse의 모든 기능을 무료로 이용할 수 있습니다. 소스 코드는 GitHub에서 가능합니다.

통합 기능 접근 방법에 자세한 내용은 ToolUniverse의 MCP 서버 문서에서 확인할 수 있습니다.

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ToolUniverse 통합 설정

ToolUniverse 통합 기능은 Claude Desktop App에서 데스크톱 확장 프로그램(여기에서 다운로드) 형태로 제공됩니다. 조직 소유자(Team 및 Enterprise 플랜)의 경우, 통합을 설정하려면 해당 확장 프로그램을 조직에서 사용할 수 있도록 설정해야 합니다. 개별 사용자의 경우, Claude 데스크톱 앱 내부에서 확장 프로그램을 설치하여 통합 기능을 설정할 수 있습니다.

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조직 소유자 대상(팀 및 엔터프라이즈)

조직이 Desktop Extension Allowlist(즉, 사용자가 접근할 수 있는 데스크톱 확장 프로그램을 제한하는 기능)를 사용하는 경우…

1. 관리자 설정 > 커넥터로 이동합니다.
2. 상단의 'Desktop' 탭을 클릭합니다.
3. 'Allowlist'가 켜짐 상태인지 확인합니다.
4. 'Browse' 버튼을 클릭합니다.
5. 검색창에 'ToolUniverse'를 입력합니다.
6. ToolUniverse를 클릭합니다.
7. '팀에 추가'를 클릭합니다.
8. 통합 기능을 이용하려면, 구성원들에게 아래의 개인 Claude 사용자 지침에 따라 Claude Desktop App을 다운로드하도록 안내합니다.

조직이 Desktop Extension Allowlist(즉, 사용자가 접근할 수 있는 데스크톱 확장 프로그램을 제한하는 기능)를 사용하지 않는 경우…

1. 관리자 설정 > 커넥터로 이동합니다.
2. 상단의 'Desktop' 탭을 클릭합니다.
3. 'Allowlist'가 꺼짐 상태인지 확인합니다.
4. Allowlist가 꺼져 있는 경우, 조직의 모든 사용자는 아래의 개인 Claude 사용자 지침에 따라 이미 Desktop 확장 프로그램 디렉터리에 접근할 수 있습니다.

개인 Claude 사용자 대상

1. Claude Desktop App을 다운로드합니다.
2. Claude Desktop App에서 Settings > Extensions로 이동합니다.
3. 'Browse extensions'를 클릭합니다.
4. 'ToolUniverse'를 클릭합니다.
5. 'Install'을 클릭합니다.

디렉터리에서 데스크톱 확장 프로그램 설치 방법을 확인하세요.

Claude Code 사용자 대상

1. 명령어 실행: /plugin marketplace add anthropics/life-sciences
2. 명령어 실행: /plugin install tool-universe@life-sciences
3. Claude Code를 다시 시작합니다.
4. 서버가 /mcp로 연결된 상태 있는지 확인

ToolUniverse 통합 기능의 기술적 세부 사항은 ToolUniverse의 MCP 서버 문서에서 확인할 수 있습니다.

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사용 사례 예시

신약 발굴 및 치료제 개발

• 치료제 발굴 및 표적-후보물질 워크플로우
• 샘플 프롬프트: “콜레스테롤혈증의 표적을 식별하고, OpenTargets와 문헌 근거를 활용해 하나를 우선 순위로 지정한 다음, 알려진 약물과 유사한 제품을 스크리닝하며, 예측 결합력과 ADMET 트레이드오프를 기준으로 후보 순위를 매겨줘. 중간 단계 근거와 최종 후보 목록을 제공해 줘."
• 워크플로우: ToolUniverse 기반 AI 과학자:
  
  • OpenTargets API를 사용하여 질병-표적 연관 정보 조회
  • RCSB PDB에서 단백질 구조 검색
  • ChEMBL 화합물 데이터로 분자 상호작용 분석
  • 통합된 ML 모델로 결합 친화도 예측
  • 치료법 개발을 위한 리서치 가설 생성

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인간 유전학 및 유전체 리서치

• 인간 유전학에서 기전으로(변이-유전자-경로)
• 샘플 프롬프트: "2형 당뇨병의 GWAS 히트를 기반으로, 변이를 후보 유전자에 매핑하고, 기능 주석과 조직 발현을 요약한 뒤, 근거가 되는 참조 문헌과 1차 출처 링크를 포함해 풍부화된 경로를 반환해 줘."
• 워크플로우: ToolUniverse 기반 AI 과학자:
  
  • GWAS 카탈로그에서 질병 연관 유전자 변이 검색
  • Ensembl 및 NCBI 데이터베이스를 활용해 SNP를 유전자에 매핑
  • Gene Ontology에서 기능 주석 검색
  • GTEx 데이터를 사용한 조직 특이 발현 분석
  • KEGG와 Reactome을 활용하여 생물학적 경로 식별

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문헌 및 다중모달 근거 종합

• 샘플 프롬프트: "PubMed와 Europe PMC를 검색하여 최근 CRISPR 오프타깃(off-target) 검출 방법을 검색하고, 주요 실험 설정과 보고된 실패 모드를 추출한 다음, 출처 인용이 포함된 구조화된 비교 테이블을 작성해 줘."
• 워크플로우: ToolUniverse 기반 AI 과학자:
  
  • 다중 데이터베이스 문헌 검색(PubMed, Europe PMC, bioRxiv)
  • 논문 자동 요약 및 핵심 결과 추출
  • Semantic Scholar 기반 인용 네트워크 분석
  • 시계열 분석을 통한 트렌드 파악
  • ClinicalTrials.gov의 임상 시험 데이터와 교차 검증

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화학 및 분자 분석

• 샘플 프롬프트: "ToolUniverse의 OpenFDA 및 ADMET-AI 도구를 사용하여, FDA 승인 고혈압 치료제의 분자 특성을 분석하고, ADMET 프로파일을 예측한 다음, 잠재적인 부작용 패턴을 식별해 줘."
• 워크플로우: ToolUniverse 기반 AI 과학자:
  
  • FDA 의약품 데이터베이스에서 승인된 의약품 조회
  • 분자 디스크립터 및 물성 계산
  • ADMET-AI 모델을 사용한 약동학 프로파일 예측
  • 구조-활성 관계 분석
  • 신약 재창출 기회 식별

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멀티툴 연구를 위한 과학적 발견 및 자동화

• 샘플 프롬프트: "여러 문헌 검색을 병렬로 실행하고, 결과를 통합해, 재현 가능한 보고서를 생성하는 재사용 가능한 워크플로우를 구축해 줘. 워크플로우를 명확한 입력과 출력이 있는 조합형 도구 형태로 반환해. 또한 ToolUniverse의 UniProt, PRIDE, KEGG 경로 도구를 사용하여, 질량 분석 데이터를 활용한 단백질 식별부터 기능 분석과 경로 매핑에 이르는, 완벽한 프로테오믹스 워크플로우를 설계해 줘."
• 워크플로우: ToolUniverse 기반 AI 과학자:
  
  • 다중모달 프로테오믹스 데이터베이스(UniProt, PRIDE) 통합
  • 프로테오믹스 산출물의 데이터 처리 및 품질 관리 자동화
  • 단백질 기능 주석 작성 및 경로 분석 수행
  • 통계 분석 완료 및 인터랙티브 시각화 생성
  • 요약이 포함된 보고서 생성

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데모 및 문서

라이브 데모

• 인터랙티브 웹 플랫폼: AIScientist.Tools - 700개 이상의 과학 도구를 탐색하기 위한 도구 검색/실행 라이브 인터페이스
• 영상 데모: YouTube에서 시청 가능
• GitHub 리포지토리: GitHub의 ToolUniverse - 전체 소스 코드, 문서, 커뮤니티(별 797개 이상)

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문서 및 튜토리얼

ToolUniverse Documentation은 설치, 사용 방법, 고급 기능에 대해 안내합니다. 또한 5분 만에 설정해 과학 도구를 즉시 실험할 수 있는 튜토리얼, 대규모 언어 모델/AI 에이전트/추론 모델과의 통합을 위한 가이드도 제공합니다.

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커뮤니티 리소스

동료 지원과 협업을 위해 Slack Community를 통해 커뮤니티 리소스에 접근할 수 있으며, 버그 신고 및 기능 요청은 GitHub Issues를 통해 할 수 있습니다.